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Academic Year/course: 2023/24

617 - Master's in Global Health: Integration of Environmental, Human and Animal Health

66859 - Omics tools in the study of health


Syllabus Information

Academic year:
2023/24
Subject:
66859 - Omics tools in the study of health
Faculty / School:
105 - Facultad de Veterinaria
Degree:
617 - Master's in Global Health: Integration of Environmental, Human and Animal Health
ECTS:
3.0
Year:
1
Semester:
Second semester
Subject type:
Optional
Module:
---

1. General information

The main objective of the subject is the management and integration of omic techniques (genomics, transcriptomics, proteomics, metabolomics, epigenomics and metagenomics) and their application in the search for biomarkers and disease resistance factors. Theoretical classes will introduce the student to the basics of omics tools. There will also be practical classes, where this knowledge will be applied to the use of bioinformatics tools and the interpretation of results. These approaches and objectives are aligned with the following Sustainable Development Goals (SDGs) of the United Nations 2030 Agenda(https://www.un.org/sustainabledevelopment/es/), specifically, the learning activities planned in this subject will contribute to the achievement of Objectives 3.3 and 3.4 (Goal 3), 4.4 (Goal 4), 8.6 (Goal 8), 9.5 (Goal 9), 12.2 (Goal 12), and 16.6 (Goal 16).

2. Learning results

  • To understand the basics of economic studies.
  • To be able to interpret the results of economic analyses.
  • To know how to design a study using economic tools.
  • To critically assess scientific articles using economic tools.
  • To know how to perform basic analysis of results obtained with economic tools.

3. Syllabus

  • BLOCK I: Introduction to omics analysis: genomics, transcriptomics, proteomics, metabolomics, epigenomics, metagenomics.
  • BLOCK II: Statistical methods for economic data analysis: pre-processing, analysis and interpretation
  • BLOCK III: Applications of omics tools for biomarker discovery: clinical development, transcriptomics and proteomics tools
  • BLOCK IV: Genomic analyses for the identification of the genetic basis of disease resistance and resilience: host genetic variation in disease resistance, selection for genetic resistance to disease.

4. Academic activities

  • Lectures (20 hours): sessions where the teacher will explain the topics mentioned in the syllabus.
  • Practical classes (10 hours): bioinformatics practices on transcriptomic, metagenomic and genome-wide association data exploration.
  • Teaching assignments (10 hours): individual work (bibliographic review), solving of practical cases in groups.
  • Autonomous student work (34 hours)
  • Assessment tests (1 hour)

5. Assessment system

There will only be a global assessment method based on the following activities (percentage of the final grade is shown):

  • Practice assessment (30%): at the end of each practice, the student will have to fill in a questionnaire to assess whether they has acquired the required competencies. The grade for this activity will be from 0 to 10, and a minimum grade of 5 out of 10 is required to pass it.
  • Group work (20%) students will have to demonstrate their ability to interpret results of omics data by solving specific cases. They will have to justify and reason their solution of the same in a written report to be submitted at the end of the term. The grade for this activity will be from 0 to 10, and a minimum grade of 5 out of 10 is required to pass it.
  • Individual work(30%): at the end of the term, the student must submit a bibliographic review of the different economic tools used in the diagnosis and prevention of a disease of their choice. The grade for this activity will be from 0 to 10, and a minimum grade of 5 out of 10 is required to pass it. It will take into account the following aspects: originality of the work (30%), understanding of the methodologies described (30%), literature review: search, understanding and interpretation (40%).
  • Final exam (20%): The acquisition of basic theoretical knowledge of the subject will be assessed by means of a final exam of 20 multiple-choice questions. The grade for this test will be from 0 to 10, and a minimum grade of 5 out of 10 is required to pass it.


Curso Académico: 2023/24

617 - Máster Universitario en Salud Global: Integración de la Salud Ambiental, Humana y Animal

66859 - Herramientas -ómicas en el estudio de la salud


Información del Plan Docente

Año académico:
2023/24
Asignatura:
66859 - Herramientas -ómicas en el estudio de la salud
Centro académico:
105 - Facultad de Veterinaria
Titulación:
617 - Máster Universitario en Salud Global: Integración de la Salud Ambiental, Humana y Animal
Créditos:
3.0
Curso:
1
Periodo de impartición:
Segundo semestre
Clase de asignatura:
Optativa
Materia:
---

1. Información básica de la asignatura

El principal objetivo de la asignatura es el manejo y la integración de técnicas -ómicas (genómica, transcriptómica, proteómica, metabolómica, epigenómica y metagenómica) y su aplicación en la búsqueda de biomarcadores y factores de resistencia a enfermedades. Las clases teóricas introducirán al alumno en las bases de las herramientas -ómicas y la teoría se intercalará con clases prácticas, donde se aplicarán estos conocimientos al uso de las herramientas bioinformáticas, y a la interpretación de resultados. Estos planteamientos y objetivos están alineados con los siguientes Objetivos de Desarrollo Sostenible (ODS) de la Agenda 2030 de Naciones Unidas (https://www.un.org/sustainabledevelopment/es/), en concreto, las actividades de aprendizaje previstas en esta asignatura contribuirán al logro de las metas 3.3 y 3.4 (Objetivo 3), 4.4 (Objetivo 4), 8.6 (Objetivo 8), 9.5 (Objetivo 9), 12.2 (Objetivo 12), y 16.6 (Objetivo 16).

2. Resultados de aprendizaje

  • Comprender las bases de los estudios -ómicos.
  • Ser capaz de interpretar resultados de análisis -ómicos.
  • Saber diseñar un estudio utilizando herramientas -ómicas.
  • Poder evaluar con un carácter crítico artículos científicos que utilicen herramientas -ómicas.
  • Saber realizar análisis básico de resultados obtenidos con herramientas -ómicas.

3. Programa de la asignatura

  • BLOQUE I: Introducción a los análisis -ómicos: genómica, transcriptómica, proteómica, metabolómica, epigenómica, metagenómica
  • BLOQUE II: Métodos estadísticos para el análisis de datos -ómicos: preproceso, análisis e interpretación
  • BLOQUE III: Aplicaciones de las herramientas -ómicas para el descubrimiento de biomarcadores: desarrollo clínico, herramientas transcriptómicas y proteómicas
  • BLOQUE IV: Análisis genómicos para la identificación de la base genética de la resistencia a las enfermedades y la resiliencia: variación genética del hospedador en resistencia a enfermedades, selección para la resistencia genética a enfermedades

4. Actividades académicas

  • Clases magistrales (20 horas): sesiones con el profesor en las que se explicará el temario de la asignatura
  • Clases prácticas (10 horas): prácticas bioinformáticas sobre exploración de datos transcriptómicos, metagenómicos y de asociación de genoma completo
  • Trabajos docentes (10 horas): trabajo individual (revisión bibliográfica), resolución de casos prácticos en grupo
  • Trabajo autónomo del estudiante (34 horas)
  • Pruebas de evaluación (1 hora)

5. Sistema de evaluación

La asignatura se evaluará solo en la modalidad de evaluación global mediante las siguientes actividades (porcentaje de la nota final indicado):

  • Evaluación de prácticas (30%). Al finalizar cada una de las prácticas el alumno tendrá que rellenar un cuestionario en el que se evaluará si ha adquirido las competencias buscadas. La calificación de esta actividad será de 0 a 10, mínimo 5 sobre 10.
  • Trabajo en grupos (20%). Los alumnos tendrán que demostrar su capacidad para interpretar resultados de  datos ómicos resolviendo unos casos determinados. Tendrán que justificar y razonar la resolución del mismo en un informe escrito que se presentará al finalizar la asignatura. La calificación de esta actividad será de 0 a 10, mínimo 5 sobre 10.
  • Trabajo individual (30%). El alumno deberá presentar al finalizar la asignatura un trabajo en el que realice una revisión bibliográfica de las distintas herramientas -ómicas utilizadas en el diagnóstico y prevención de una enfermedad a su elección. La calificación de esta actividad será de 0 a 10, mínimo 5 sobre 10, y tendrá en cuenta los siguientes aspectos: originalidad del trabajo (30%), comprensión demostrada de las metodologías descritas (30%), revisión bibliográfica: búsqueda, comprensión e interpretación (40%).
  • Examen final (20%). Se realizará una evaluación de la adquisición de conocimientos teóricos básicos de la asignatura por examen final de 20 preguntas tipo test. La calificación de esta prueba será de 0 a 10, mínimo 5 sobre 10.