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Academic Year: 2022/23

446 - Degree in Biotechnology

27109 - Microbiology


Teaching Plan Information

Academic Year:
2022/23
Subject:
27109 - Microbiology
Faculty / School:
100 - Facultad de Ciencias
Degree:
446 - Degree in Biotechnology
ECTS:
9.0
Year:
2
Semester:
Annual
Subject Type:
Compulsory
Module:
---

1. General information

2. Learning goals

3. Assessment (1st and 2nd call)

3.1. Assessment tasks (description of tasks, marking system and assessment criteria)

Total or partial fraud or plagiarism in any of the evaluation tests will result in the immediate termination of the course for the student, who will get the lowest mark. Disciplinary actions will be undertaken, according to the University regulations on the field.

All learning and assessment activities will be done on site, at the Faculty of Sciences and the Faculty of Medicine, unless the University of Zaragoza or other local, regional or national authorities, due to sanitary reasons, could decide to do such activities on line.

4. Methodology, learning tasks, syllabus and resources

4.1. Methodological overview

The methodology followed in this course is oriented towards the achievement of the learning objectives.  A wide range of teaching and learning tasks are implemented which includes the following activities: 

  • Activity 1: Learning fundamentals of Microbiology (5 ECTS). Methodology: Participative lectures in a single group, and problem based sessions in two smaller groups. Both activities will take place in the days and times scheduled for the lectures. Supporting materials will be available from ADD (https://moodle2.unizar.es/add/), which will be updated every year. Individual follow-up will be available from all professors participating in this course.
  • Activity 2: Practice sessions (laboratory) (3 ECTS). Methodology: Problem-based learning, and case-based learning. Supporting materials will be available from ADD (https://moodle2.unizar.es/add/), which will be updated every year. Practical courses will take place in small groups. Individual and team work.
  • Activity 3: Supervised work (seminars and practical cases) (1 ECTS). Methodology: Seminars, supervised practical work, and critical review of scientific literature. Supporting materials will be available from ADD (https://moodle2.unizar.es/add/), which will be updated every year. Oral presentations will be done in front of the group . Individual and team work.

4.2. Learning tasks

All learning activities and evaluation activities will be done on site, at the Faculty of Sciences and the Faculty of Medicine, unless the University of Zaragoza or other local, regional or national authorities, due to sanitary reasons, could decide to do such activities on line.

The course includes the following learning tasks: 

1) Lectures and problem-based sessions. These two activities will be according to the following program:

  • Introduction to Microbial Biology. History, concept and methods in Microbiology. Basic characteristics of different groups of microorganisms, metabolism, microbial growth, antimicrobial agents, and genetics and microbial molecular genetics.
  • Microbial biodiversity. Gram positive and Gram negative bacteria, archaeobacteria, fungi, algae, viruses, parasites
  • Applied Microbiology. Role of microbes in specific aspects: medicine, environment, food, industry, etc.

2) Practice sessions.

  • Safety regulations and basic manipulations in a microbiology laboratory.
  • Culture and identification of microorganisms by biochemical tests, microscope observations, staining, etc.
  • Antimicrobial susceptibility testing
  • Microbiology-based processes in food and industry
  • Microbiological analysis of clinical, food and environmental samples.
  • If available, visit to the Biosafety Laboratory (Faculty of Medicine)

All students will be informed of risks in the accomplishment of practical sessions in this subject, as well as if handling hazardous products and what to do in case of accident. All students must sign the commitment to comply with the rules of work and safety to perform practical sessions. For more information, consult the information for students in the risk prevention unit: http://uprl.unizar.es/estudiantes.html.

 

4.3. Syllabus

The course will address the following topics: 

Lectures

PART I: INTRODUCTION TO BIOLOGY OF MICROORGANISMS

  • Topic 1: History, methods and fundamentals of Microbiology
  • Topic 2: A perspective of microbial world
  • Topic 3: Characteristics of prokaryotic microorganisms
  • Topic 4: Microbial growth and metabolism
  • Topic 5: Microbial growth control
  • Topic 6: Antimicrobial agents
  • Topic 7: Microbial genetics and molecular biology. Metagenomics.
  • Topic 8: Microbiota and host-pathogen interactions

PART II: MICROBIAL DIVERSITY

  • Topic 9: General characteristics of viruses
  • Topic 10: Plant and animal viruses
  • Topic 11: Bacteriophages and other subcellular infectious agents
  • Topic 12: Gram-negative bacteria (proteobacteria)
  • Topic 13: Gram-positive bacteria
  • Topic 14: Other phyla of Bacteria. Archaebacteria.
  • Topic 15: Introduction to eukaryotic microorganisms: Fungi, algae, environmental protozoa.
  • Topic 16: Parasitic protozoa
  • Topic 17: Parasitology: nematodes
  • Topic 18: Parasitology:cestodes and trematodes
  • Topic 19: Parasitology: arthropods

PART III: APPLIED MICROBIOLOGY

  • Topic 20: Clinical Microbiology
  • Topic 21: Water Microbiology
  • Topic 22: Soil Microbiology
  • Topic 23: Food Microbiology
  • Topic 24: Industrial Microbiology

SEMINARS

  • Seminar 1: Bactericidal activity of household cleaning products
  • Seminar 2: Microbial genetics
  • Seminar 3: Serology in diagnostics
  • Seminar 4: Diagnostics of viral infections
  • Seminar 5: Case studies in bacteriology
  • Seminar 6: Encyclopedia of Microbiology

Practice  sessions 

  • Part 1: Basic Microbiology procedures
  • Part 2: Clinical Microbiology
  • Part 3: Parasitology

4.4. Course planning and calendar

Schedules of lectures and problems will coincide with the officially established and will be available at: https://ciencias.unizar.es/grado-en-biotecnologia.

The places, calendar and groups for training and practical sessions will be established in coordination with the rest of the subjects at beginning of course. The Coordinator will produce the groups of students for these activities at beginning of course to avoid overlaps with other subjects.

Lectures: 3 hours per week, in both first and second term. Details are available from http://ciencias.unizar.es/web/horarios.do

Seminars, problems, etc. same time schedule as for the lectures.Practical courses: there will be three practical courses along the academic year, each having a different number of hours. Dates, locations, and students attending every session will be announced in the classroom, in the notice board and in ADD.

For students enrolled in the subject, places, times and dates of lectures and practical sessions will be public via Notice Board advertisements of the grade on the platform Moodle at the University of Zaragoza, https://moodle2.unizar.es/add/, and in the moodle page for the course. These routes will be also used to communicate enrolled students their distribution by groups of practical sessions, which will be organized by the coordination of degree.  Provisional dates will be available on the website of the Faculty of Sciences in the corresponding section of the Degree in Biotechnology: https://ciencias.unizar.es/grado-en-biotecnologia.

In this web there will be also available the dates of exams.

4.5. Bibliography and recommended resources

http://psfunizar10.unizar.es/br13/egAsignaturas.php?codigo=27109

 


Curso Académico: 2022/23

446 - Graduado en Biotecnología

27109 - Microbiología


Información del Plan Docente

Año académico:
2022/23
Asignatura:
27109 - Microbiología
Centro académico:
100 - Facultad de Ciencias
Titulación:
446 - Graduado en Biotecnología
Créditos:
9.0
Curso:
2
Periodo de impartición:
Anual
Clase de asignatura:
Obligatoria
Materia:
---

1. Información Básica

1.1. Objetivos de la asignatura

La asignatura y sus resultados previstos responden a los siguientes planteamientos y objetivos:

Se trata de una asignatura obligatoria de carácter básico dentro del Módulo Fundamental del plan de estudios del Grado en Biotecnología. Como tal, presenta a los estudiantes una aproximación básica a los microorganismos, sus características y los procedimientos más habituales de trabajo con microorganismos; todo esto supone una formación básica para los estudiantes. Además, introduce los aspectos y procesos más importantes en los que participan microorganismos, tanto desde el punto de vista básico como del punto de vista biotecnológico.

Estos planteamientos y objetivos están alineados con los siguientes Objetivos de Desarrollo Sostenible (ODS) de la Agenda 2030 de Naciones Unidas (https://www.un.org/sustainabledevelopment/es/), de tal manera que la adquisición de los resultados de aprendizaje de la asignatura proporciona capacitación y competencia para contribuir en cierta medida a su logro: Objetivo 3: Salud y bienestar; Objetivo 4: Educación de calidad; Objetivo 6: Agua limpia y saneamiento; Objetivo 7: Energía asequible y no contaminante; Objetivo 9: Industria, innovación e infraestructuras; Objetivo 13: Acción por el clima; Objetivo 15: Vida de ecosistemas terrestres.

1.2. Contexto y sentido de la asignatura en la titulación

La Microbiología es una asignatura obligatoria dentro del Módulo Fundamental del plan de estudios del Grado en Biotecnología. Esta asignatura, junto con otras asignaturas del mismo módulo, proporciona conocimientos y habilidades necesarios o complementarios para comprender y trabajar en otras asignaturas relacionadas, tanto del propio Módulo fundamental (Bioquímica, Inmunología, Biología Molecular, Ingeniería Genética, etc) como del Módulo Avanzado (Biotecnología Clínica, Biorreactores, Biotecnología del Medio Ambiente, Biotecnología Microbiana, etc) y de algunas asignaturas optativas (Bioquímica y Microbiología Enológica, Biotecnología Alimentaria, Biotecnología aplicada a la Inmunología y Microbiología, etc).

1.3. Recomendaciones para cursar la asignatura

- Haber cursado o estar cursando la asignatura Biología, del primer curso de esta titulación, y repasar los conocimientos adquiridos en esa asignatura
- Asistir a las clases teóricas con asiduidad y asimilar los contenidos de forma progresiva
- Asistir a las sesiones prácticas
- Participar en las clases de problemas, seminarios, casos, etc.

- Presentar los trabajos y cuadernos de prácticas que se soliciten
- Frecuentar las tutorías con los profesores responsables de la asignatura

2. Competencias y resultados de aprendizaje

2.1. Competencias

Al superar la asignatura, el estudiante será más competente para...

Distinguir los diversos grupos de microorganismos (hongos, bacterias, virus, parásitos, etc.) y conocer sus tipos principales.

Conocer las características básicas del crecimiento microbiano y los métodos para su control.

Conocer los procesos y ámbitos específicos en los que intervienen los microorganismos.

Realizar manipulaciones básicas de los microorganismos en el laboratorio.

Elaborar y defender informes relacionados con la asignatura.

2.2. Resultados de aprendizaje

El estudiante, para superar esta asignatura, deberá demostrar los siguientes resultados...

Distinguir los diversos grupos de microorganismos (hongos, bacterias, virus, parásitos, etc.) y conocer sus tipos principales.

Conocer la implicación de los microorganismos en los ámbitos biotecnológico, medioambiental, alimentario, clínico, etc.

Realización de manipulaciones básicas de los microorganismos en el laboratorio, incluyendo pruebas fundamentales de identificación, aislamiento y cultivo, así como manejar el microscopio óptico, y monitorización de procesos biotecnológicos de base microbiana a escala de laboratorio.

Buscar y analizar información específica relacionada con la asignatura.

Elaboración, defensa e interpretación de informes relacionados con el ámbito de la Microbiología.

2.3. Importancia de los resultados de aprendizaje

Los conceptos y técnicas de laboratorio que se aprenderán en la asignatura de Microbiología son básicos para trabajar en otras asignaturas relacionadas y para comprender numerosos procesos biotecnológicos de base microbiana.

3. Evaluación

3.1. Tipo de pruebas y su valor sobre la nota final y criterios de evaluación para cada prueba

El estudiante deberá demostrar que ha alcanzado los resultados de aprendizaje previstos mediante las siguientes actividades de evaluacion

Realización de una prueba teórico-práctica parcial a mitad de curso (primer parcial; convocatoria de Enero) y otra al final (segundo parcial; convocatoria de Junio). En la convocatoria de Junio habrá una nueva oportunidad para realizar el primer parcial, y cuyo resultado sustituirá a la calificación del primer parcial obtenida en la convocatoria de Febrero.

Será necesario superar ambos parciales para aprobar la asignatura.

No se guardan parciales (aprobados en enero o en junio) para la convocatoria extraordinaria final de julio, que consistirá en una única prueba teórico-práctica sobre el contenido de toda la asignatura entera.

La valoración de los conocimientos adquiridos mediante estas pruebas supondrá el 65% de la nota final de la asignatura.

 

Evaluación del aprendizaje del alumno durante el desarrollo del curso, mediante la resolución de problemas y cuestiones propuestas por el profesor de la asignatura, y mediante la presentación escrita y oral de informes sobre los trabajos tutorizados. Esto supondrá un 20% de la nota final de la asignatura, y se desglosa de esta forma: prueba escrita sobre resolución de problemas (3%), presentación y defensa de seminarios (4%), método del caso (3%), y la Enciclopedia de la Microbiología (10%). En aquellos trabajos que supongan la presentación de un informe escrito y la realización de una presentación oral, el 30% de la nota corresponderá al trabajo escrito y el 70% restante a la presentación oral.

 

La evaluación de las prácticas de laboratorio supondrá un 15% de la nota final de la asignatura. Consistirá en la resolución de pruebas escritas sobre los contenidos de las prácticas de los bloques I y III (10%) y en la presentación de un informe del bloque II de prácticas (5%).

 

Finalmente, los alumnos que así lo deseen, podrán optar a una prueba final global que juzgará si se han alcanzado los objetivos de aprendizaje previstos en la asignatura.

El temario que los estudiantes deben utilizar para preparar las diferentes pruebas se encuentra en el apartado "Actividades y recursos" de esta misma guía docente

Las calificaciones obtenidas en las distintas actividades se mantendrán durante el curso académico en que se hayan conseguido. No se guardarán para cursos posteriores.

El fraude o plagio total o parcial en cualquiera de las pruebas de evaluación dará lugar al suspenso de la asignatura con la mínima nota, además de las sanciones disciplinarias que la comisión de garantía adopte para estos casos.

Las actividades docentes y de evaluación se llevarán a cabo de modo presencial salvo que, debido a la situación sanitaria, las disposiciones emitidas por las autoridades competentes y por la Universidad de Zaragoza dispongan realizarlas de forma telemática.

4. Metodología, actividades de aprendizaje, programa y recursos

4.1. Presentación metodológica general

El proceso de aprendizaje que se ha diseñado para esta asignatura se basa en lo siguiente:

Actividad Formativa 1: Adquisición de conocimientos básicos de Microbiología (5 ECTS).
Metodología:
Clases magistrales participativas en grupo grande, y sesiones de problemas. Las clases de problemas se impartirán en dos grupos, en el horario previsto para las clases de teoría. El material de apoyo estará disponible en el ADD (https://moodle2.unizar.es/add/) y su contenido se actualizará cada curso.
Tutorías individualizadas.

Actividad Formativa 2: Prácticas de laboratorio (3 ECTS).
Metodología:
Aprendizaje basado en problemas y casos prácticos. El material de apoyo estará disponible en el ADD (hhttps://moodle2.unizar.es/add/) y su contenido se actualizará cada curso. Las prácticas de laboratorio se realizarán en grupos reducidos. Trabajo en equipo e individual.

Actividad Formativa 3: Realización de trabajos tutorizados (1 ECTS).
Metodología:
Valoración de trabajos bibliográficos, seminarios y trabajos prácticos tutorizados. El material de apoyo estará disponible en el ADD (https://moodle2.unizar.es/add/) y su contenido se actualizará cada curso.
Exposición oral en clase.
Trabajo en equipo e individual.

4.2. Actividades de aprendizaje

Las actividades docentes y de evaluación se llevarán a cabo de modo presencial salvo que, debido a la situación sanitaria, las disposiciones emitidas por las autoridades competentes y por la Universidad de Zaragoza dispongan realizarlas de forma telemática.

El programa que se ofrece al estudiante para ayudarle a lograr los resultados previstos comprende las siguientes actividades:

1) Clases magistrales participativas y de problemas

Estas actividades seguirán el siguiente programa:

Introducción a la Biología de Microorganismos.
Historia, concepto y métodos de la Microbiología, características de los distintos grupos de microorganismos, metabolismo y crecimiento microbiano, agentes antimicrobianos y genética y biología molecular microbiana.

Biodiversidad microbiana.
Bacterias Gram negativas y Gram positivas, Arqueobacterias, Hongos, Algas, Virus, Parásitos.

Microbiología Aplicada.
Estudio de la implicación de los microorganismos en diversos procesos o ámbitos específicos: clínica, medio ambiente, alimentación, procesos industriales, etc.

 

2) Programa de prácticas de laboratorio

  • Normas de seguridad y manipulaciones básicas en el laboratorio microbiológico.
  • Cultivo e identificación de microorganismos mediante pruebas bioquímicas, observaciones al microscopio, tinciones, etc.
  • Técnicas de sensibilidad a los antimicrobianos.
  • Procesos microbiológicos de interés industrial y alimentario.
  • Análisis microbiológico de muestras clínicas, medioambientales y de alimentos.
  • En función de la disponibilidad, visita al Laboratorio de Seguridad Biológica (Facultad de Medicina)

Todo alumno será informado sobre los riesgos que puede tener la realización de las prácticas de esta asignatura, así como si se manejan productos peligrosos y qué hacer en caso de accidente, y deberá firmar el compromiso a cumplir con las normas de trabajo y seguridad para poder  realizarlas. Para más información, consultar la información para estudiantes de la Unidad de Prevención de Riesgos Laborales: http://uprl.unizar.es/estudiantes.html.

 

4.3. Programa

PROGRAMA DE CLASES TEÓRICAS

I. INTRODUCCIÓN A LA BIOLOGÍA DE MICROORGANISMOS

Tema 1: Historia, concepto y métodos de la Microbiología.

Tema 2:  El mundo microbiano

Tema 3: Características de los microorganismos procariotas (y diferencias con eucariotas).

Tema 4: Metabolismo y crecimiento microbiano.

Tema 5: Control del crecimiento microbiano.

Tema 6: Agentes antimicrobianos

Tema 7: Genética microbiana y biología molecular. Metagenómica.

Tema 8: Microbiota, interacciones con el hospedador y patogenicidad microbiana.

II. DIVERSIDAD MICROBIANA

Tema 9: Características generales de los virus.

Tema 10: Virus de animales y plantas.

Tema 11: Bacteriófagos y otros agentes infecciosos subcelulares.

Tema 12: Bacterias Gram negativas (proteobacterias)

Tema 13: Bacterias Gram positivas.

Tema 14: Otros phyla de Bacteria. Arqueobacterias

Tema 15: Introducción eucariotas. Hongos. Algas. Protozoos en el medio ambiente.

Tama 16: Protozoos parásitos.

Tema 17: Parasitología: Nematodos

Tema 18: Parasitología: Cestodos y trematodos

Tema 19: Parasitología: Artrópodos

III. MICROBIOLOGÍA APLICADA

Tema 20: Microbiología Clínica

Tema 21: Microbiología del medio acuático

Tema 22: Microbiología del  suelo

Tema 23: Microbiología de alimentos

Tema 24: Microbiología industrial.

 

SEMINARIOS, CASOS, PROBLEMAS

1.- Actividad bactericida de productos de limpieza

2.- Genética microbiana

3.- Diagnóstico serológico

4.- Diangóstico de infecciones virales

5.- Método del caso (bacteriología)

6.- Enciclopedia de la Microbiología

 

PRÁCTICAS DE LABORATORIO

Bloque 1: Procedimientos microbiológicos básicos

Bloque 2: Microbiología Clínica

Bloque 3: Parasitología

4.4. Planificación de las actividades de aprendizaje y calendario de fechas clave

Calendario de sesiones presenciales y presentación de trabajos

El periodo de clases teóricas y de problemas coincidirá con el establecido oficialmente. Consultar en: https://ciencias.unizar.es/grado-en-biotecnologia.

Los lugares de impartición de las sesiones, el calendario y los grupos de prácticas se establecerán de manera coordinada con el resto de materias a principio de curso. El coordinador confeccionará los grupos de prácticas a principio de curso con el objeto de no producir solapamientos con otras asignaturas.

 

Clases teóricas: 3 horas semanales durante el primer y segundo cuatrimestre. Consultar en: http://ciencias.unizar.es/web/horarios.do
Clases de problemas: se integrarán en el horario previsto para las clases teóricas.
Prácticas de laboratorio: se estructurarán en tres bloques, de distinta duración, repartidos durante los dos cuatrimestres. Las fechas concretas y la composición de los grupos de prácticas se anunciará oportunamente en el aula, en el tablón de anuncios del Grado en Biotecnología, y en el ADD.

Esta es una asignatura anual de 9 ECTS.

Para aquellos alumnos matriculados, los lugares, horarios y fechas de clases teóricas y sesiones prácticas se harán públicos a través del TABLON DE ANUNCIOS DEL GRADO en la plataforma Moodle de la Universidad de Zaragoza  https://moodle2.unizar.es/add/ y en el moodle de la asignatura. Dichas vías serán también utilizadas para comunicar a los alumnos matriculados su distribución por grupos de prácticas que serán organizados desde la Coordinación del Grado.  

Unas fechas provisionales se podrán consultar en la página web de la Facultad de Ciencias en la sección correspondiente del Grado en Biotecnología: https://ciencias.unizar.es/grado-en-biotecnologia.

En dicha web se podrán consultar también las fechas de exámenes en el apartado Grado en Biotecnología.

 

4.5. Bibliografía y recursos recomendados

http://psfunizar10.unizar.es/br13/egAsignaturas.php?codigo=27109