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Academic Year/course: 2021/22

626 - Máster Universitario en Biofísica y Biotecnología Cuantitativa / Master in Biophysics and Quantitative Biotechnology

68458 - Medicinal Chemistry

Syllabus Information

Academic Year:
68458 - Medicinal Chemistry
Faculty / School:
100 - Facultad de Ciencias
626 - Máster Universitario en Biofísica y Biotecnología Cuantitativa / Master in Biophysics and Quantitative Biotechnology
Second semester
Subject Type:

1. General information

1.1. Aims of the course

This course and its expected results respond to the following approaches and objectives:

One of the main objectives of this subject is to provide students with an overview of medicinal chemistry at the intersection between synthetic organic chemistry, pharmacology and medicine, directly related with other biological subjects which are also addressed in this master's degree. This subject will emphasize aspects such as the design, chemical synthesis and development of pharmaceutical agents or bioactive molecules, as well as the launch to the market of these compounds and their patentability. In addition, students are expected to become familiar with the synthesis of organic compounds used as drugs and to acquire knowledge of other more complex structures such as proteins and derivatives.

Students will be able to understand the use of synthetic organic chemistry and computational chemistry as tools closely related to biological chemistry, enzymology and structural biology, with the aim of discovering and developing new therapeutic agents.

Moreover, key chemical compounds and structural families will be identified for their subsequent therapeutic use. On the other hand, synthetic and computational aspects will be included in the study and development of drugs and their relationship with their biological activity, i.e., the understanding of their structure-activity relationship (SAR).

These approaches and objectives agree with the following Sustainable Development Goals (SDGs) of the United Nations Agenda 2030 (, in such a way that the acquisition of the learning results of this subject provides training and competence to contribute to a certain extent to its achievement:

Goal 3: Health and wellness

Goal 4: Quality education

1.2. Context and importance of this course in the degree

This elective subject, which belongs to the third module of the master's degree that includes the subjects of the second semester, will allow students to deepen their training as molecular biotechnologists, enabling them to configure a personalized curriculum in which they can combine instrumental, methodological, statistical, modeling and/or related to the creation and management of biotechnology companies. 

This elective course is really necessary and coherent in this master's degree where, after the student has taken the obligatory courses of the first four-month period, he/she can study in depth the design, obtaining and improvement of new compounds for their biological evaluation, with the ultimate aim of establishing relationships between the chemical structure and the biological activity that contribute to the development of new drugs.

This course will make the student aware of the problems involved in the interaction of drugs with the biological environment (usually the human body) in which they must exert their effect.

It is also essential for students to acquire knowledge about how the pharmaceutical industry works. This is one of the most dynamic industrial sectors which, being related to health, continues growing due to the social demand for new, more effective, safer and personalized drugs.

This subject contributes to answer all these aspects that are not addressed in the other subjects of this master.

1.3. Recommendations to take this course

It is recommended that the students assist to the whole course.

2. Learning goals

2.1. Competences

Upon successful completion of the course, the student will be more competent to:

Basic competences of this subject:

CB6 – To have and to understand knowledge that provides a basis or an opportunity to be original in the development and / or implementation of ideas, often in a research context.

CB7 – The students know how to implement the acquired knowledge and their ability to solve problems in new or little-known environments within broader (or multidisciplinary) contexts related to their area of ​​study.

CB8 – The students are able to integrate knowledge and face the complexity of providing opinions based on information that, being incomplete or limited, includes reflections on social and ethical responsibilities linked to the application of their knowledge and opinions.

CB9 - The students know how to communicate their conclusions and the latest knowledge and reasons that support them to specialized and non-specialized audiences in a clear and unambiguous way.

CB10 - The students have the learning skills that allow them to continue studying, largely self-directed or autonomously.


Specific competences of this subject:

CE05 – To design cell and animal tests of toxicity, bioavailability and effectiveness of bioactive compounds.

CE06 – Apply statistical techniques to carry out studies that relate molecular structure with biological activity and allow to generate predictive models.

CE018 - Evaluate the interest of a determined molecule or biological structure as a therapeutic target.

CE019 - Know the basic tools of Medical Chemistry.

CE020 - Design pharmacokinetic and pharmacodynamic tests adapted to specific compounds.

CE021 - Apply design principles to improve the ADMET properties of candidate compounds.

CE022 - Understand the approval and marketing process of a drug.


Generic competences of this subject:

CG01 – To arrange, analyze critically, understand and synthesize information.

CG02 – To obtain information from different types of sources and evaluate their reliability.

CG03 – To learn efficiently through autonomous study and acquire a significant level of independence.

CG04 – To implement the acquired knowledge and solve problems in new or unfamiliar environments within broader (or multidisciplinary) contexts related to the study area.

CG05 – To formulate, analyze, evaluate and compare new or alternative solutions for different problems.

CG07 – To develop capacity for criticism and self-criticism.

CG09 - Be able to develop a project, participating in the stages of bibliographic search, experiment planning, obtaining results, interpretation, and dissemination of the same.

2.2. Learning goals

The student, in order to pass this subject, must demonstrate the following results:

1. To know the main therapeutic targets for which drugs exist.

2. To know the main design tools used in Medical Chemistry.

3. To know the ADMET tests that are carried out on a candidate molecule to evaluate its potential as a drug.

4. To know the strategies of Medical Chemistry to improve the ADMET properties of a compound.

5. To understand the pathway that a preclinically evaluated compound follows before it becomes a commercial drug.

2.3. Importance of learning goals

They serve, first of all, to introduce students into the world of medicinal chemistry and its relation with drugs, as well as to the entire route that the drugs follow until they reach the market.

They allow the student to face the synthesis of a given simple drug with the basic design tools in Medicinal Chemistry (organic synthesis and computational tools).

They provide students with tools for computational analysis of the characteristics of a biologically active molecule in order to establish its structure-activity relationships (SARs).

All of the above-mentioned will be of great help to successfully face the learning of other subjects of this master's degree and also during the future professional career of the students.

3. Assessment (1st and 2nd call)

3.1. Assessment tasks (description of tasks, marking system and assessment criteria)

The student must demonstrate the achievement of the learning outcomes through the following evaluation activities.

A continuous evaluation will be carried out. However, the students will also have the option of taking the global evaluations according to the UZ exam calendar for the two official calls.

The activities and evaluation criteria for the continuous evaluation and the global evaluation (first and second call) are described below.


Continuous Evaluation

1. Problem solving classes and case studies (20% of FG)

The resolution of these exercises constitutes an individual or group work of the students. The students must submit a report at the end of each session following the guidelines and presentation format to be indicated. The qualifications and the corrected exercises will be made available to students. These types of controls are framed within the concept of continuous evaluation, which will allow monitoring of the learning process.


2. Theoretical Exam (50% of FG)

The theoretical exam will consist of questions that require either short answers (limited response tests) or a broad development of the topic (essay tests or free and open answer). The first type will allow a comprehensive sampling of the student's knowledge of the subject, and the second type will allow an assessment of their ability to express themselves, to present and keep arguments, and to make critical judgments. The written test will be based on the scheduled learning activities.

In order to take the exam, the student will be able to consult the bibliography that he/she considers appropriate (web pages or similar cannot be consulted).


3. Evaluation tests of the practical computer sessions (30% of FG)

The student must demonstrate that he/she is making good use of the internship sessions.


Compulsory attendance. The following will be valued: 1. The development of the practice by the student: that is, the way in which the student carries out the practice taking into account the following criteria: -The student is able to work autonomously following the protocol. 2. The report presented at the end of the practices, taking into account the following criteria: - Describe in a convenient way the methods used - Correctly interpret the results - In case of discrepancy in the results, find out the cause of the error and amend it.


4. Complementary activities (up to 1 extra point on the FG)

The activities (seminars, conferences, debates, etc.) that may be proposed as voluntary option may represent an extra mark on the final grade of the course up to a maximum of 1 point.

FG = 0.20 MProblem solving + 0.5 MTheoretical Exam + 0.30 NComputer Sessions


Global Evaluation (100% of FG)

1. Theoretical Exam (100% of FG)

The theoretical exam will consist of questions that require short answers (limited response tests) or that require a broad development of the topic (essay tests or free and open answer).

In order to take the exam in the global evaluation, the student will not be able to consult the bibliography.

FG = 1 MTheoretical Exam


Therefore, the overall grade (OG) of the course will be the final grade (FG), calculated as the weighted average of the evaluation activities described above + the possible extra grade derived from the complementary activities. The extra grade mentioned above will only be added to the GC if it is higher or equal to 4 points out of 10, both in first and second call. The GC will not be able in any case, to exceed the numerical qualification of 10.


OG**** = FG + extra grade (CA)

*** The overall grade (OG) will result from the addition to FG of the extra grade (up to 1 point), obtained from the complementary tasks performed on a voluntary basis. These will only be added if FG is equal or higher than 4, in both calls.


In the evaluation of the tests described above, the accuracy, thoroughness and approach of the answers, as well as the argumentation and critical analysis of them will be positively valued. The understanding of concepts and processes, and the ability to interrelate them, as well as the concreteness, clarity, order and presentation will be also assessed.

If plagiarism or other fraudulent actions are detected and confirmed, this will be sufficient reason to evaluate the student with the lowest possible grade on the corresponding test.

The evaluation of this course is planned to be carried out face-to-face, whenever possible. Otherwise, and following the guidelines set out, the evaluation activities will be adapted to allow them to be carried out remotely, trying to maintain, as far as possible, the typology and criteria set out here.

4. Methodology, learning tasks, syllabus and resources

4.1. Methodological overview

The learning process designed for this course is based on lectures of a participative nature that will be complemented with problem classes, seminars (which may be given by professionals), practical computer sessions and tutorials.

The theoretical contents of the course will be presented, as well as practical examples that clarify the concepts presented.

4.2. Learning tasks

The program provided to the student to help him/her achieve the expected results includes the following activities:

Master class

Master classes and participative lectures given by the professor, where external experts and/or the students themselves may also intervene.

Problem solving and case studies

The teacher will propose problems and practical cases to be solved individually or in groups. The possible solutions to the problems will be solved and discussed in class, promoting the participation of the students. In addition, the teacher will propose problems and case studies as tasks to be carried out by the student.

Laboratory practices

Students will perform computer practices corresponding to the practices program. These activities will instruct the student on how to approach experimental techniques or computational methods, present data and results provided by the application of these.

Finally, the results will be shared and discussed with the other students. This part of the course requires individual work by the student. These activities will enable the student to acquire the capacity and skills necessary to describe, quantify, analyze and critically evaluate the results obtained, as well as to use the experimental techniques and methods related to this Master and to design technical and methodological alternatives, all of these by themselves. 

Discussions, seminars and conferences

Personalized teacher-student mentoring

Independent student work

Evaluation tests


4.3. Syllabus

Theoretical Program

MIODULE I. Drug targets and drugs

1.- Enzymes and receptors as pharmacological targets

2.- Nucleic acids and other pharmacological targets

3.- Antimicrobial agents

4.- Anticancer agents

5.- Drugs for the central nervous system

6.- Other drugs

MODULE II. Basic tools in Medical Chemistry

7.- Find lead compounds

8.- Combinatorial synthesis

9.- Chiral drugs and their synthesis

10.- (Q)SARs to guide Medical Chemistry

11.- Computers in Medical Chemistry

MODULE III. Drug characterization: pharmacokinetics and pharmacodynamics

12.- Chemical characterization of the lead compounds

13.- Pharmacokinetics and pharmacodynamics

14.- Safety and Toxicology

15.- Animal models of disease

MODULE IV. Chemical strategies to improve drugs

16.- Improvement of solubility and affinity for the target

17.- Improvement of chemical and metabolic stability

18.- Improvement of protein binding and permeability

19.- Decreased toxicity

20.- Improved administration (prodrugs and encapsulation)

MODULE V. From the drug to the patient

21.- Intellectual property and patents in drug discovery

22.- Fundamentals of clinical trials

23.- Bringing the drug to the market

24.- Illustrative examples in drug discovery


Note: The order of these topics may be changed, depending on teaching and organizational needs.


Practices program.  The student will perform a type A or type B practice.

Practice type A.  During 7 computer sessions of 3 hours, the student will convert a molecule (hit), active against a target of known structure, into a lead, ideally addressing all of the following:

 Design of a synthetic route for the hit to facilitate the synthesis of derivatives.

  • Calculation of its solubility and its ADMET properties.
  • In view of these properties and the desired pharmacological activity: proposal of improved variants by design of derivatives or by searching for analogues by similarity, substructure or pharmacophore.
  • Proposal of a formulation and an administration protocol to test its pharmacological activity in an animal model.
  • Writing a patent application.
  • Design of a Phase I clinical trial.


Practice type B. During 7 computer sessions of 3 hours, the student will be in charge of redesigning a protein drug in order to achieve:

  • Improving protein stability (solubility, conformational stability, tendency to aggregate, presence of proteolysis or modification sequences).
  • Incorporating, if applicable, cellular vehiculation functionalities.
  • Planning strategies to optimize target affinity.


The student will design a new protein drug sequence that, with as few changes as possible, solves the initial problems of the molecule. He/she will also design a suitable expression vector to produce the drug recombinantly. In the case of designing a vaccine, instead of an expression vector, an immunization vector will be designed.


Note: The practices program may be slightly altered, depending on teaching and organizational needs.

4.4. Course planning and calendar

Schedule of classroom sessions and presentation of homework

This is a 6 ECTS course that is scheduled within the group of electives that can be taken in the second semester of the first year of the Master in Biophysics and Quantitative Biotechnology.

All information about timetables and exam schedules is published on the website of the Faculty of Science.

In reprographics and/or through the Digital Teaching Ring, students will be provided with a variety of teaching materials.


The teaching of this course is planned to be carried out face-to-face, whenever possible.  Otherwise, and following the guidelines set out, the evaluation activities will be adapted to allow them to be carried out remotely, trying to maintain, as far as possible, the typology and criteria set out here.

4.5. Bibliography and recommended resources

Curso Académico: 2021/22

626 - Máster Universitario en Biofísica y Biotecnología Cuantitativa / Master in Biophysics and Quantitative Biotechnology

68458 - Química Médica

Información del Plan Docente

Año académico:
68458 - Química Médica
Centro académico:
100 - Facultad de Ciencias
626 - Máster Universitario en Biofísica y Biotecnología Cuantitativa / Master in Biophysics and Quantitative Biotechnology
Periodo de impartición:
Segundo semestre
Clase de asignatura:

1. Información Básica

1.1. Objetivos de la asignatura

La asignatura y sus resultados previstos responden a los siguientes planteamientos y objetivos:

Uno de los objetivos principales de esta asignatura es proporcionar a los estudiantes una descripción general de la química médica en la intersección entre la química orgánica sintética, la farmacología y la medicina, en su relación con otras especialidades biológicas diferentes con las que se encuentra directamente relacionada y que también se abordan en este máster.  En esta asignatura se hará hincapié en aspectos tales como el diseño, la síntesis química y el desarrollo de agentes farmacéuticos o moléculas bioactivas, así como la llegada al mercado de estos compuestos y su patentabilidad. Además, se persigue que los estudiantes se familiaricen con la síntesis de compuestos orgánicos utilizados como medicamentos y que adquieran conocimiento de otras estructuras más complejas como son las proteínas y todos sus derivados. También se buscará que los estudiantes sean capaces de entender el uso de la química orgánica sintética y la química computacional como herramientas estrechamente relacionadas con la química biológica, la enzimología y la biología estructural, con el objetivo de descubrir y desarrollar nuevos agentes terapéuticos.

Así, se identificarán compuestos químicos y familias estructurales clave para su posterior uso terapéutico. Por otro lado, se incluirán aspectos sintéticos y computacionales en el estudio y desarrollo de fármacos y su relación con su actividad biológica, es decir, la comprensión de su relación estructura-actividad (SAR).

Estos planteamientos y objetivos están alineados con los siguientes Objetivos de Desarrollo Sostenible (ODS) de la Agenda 2030 de Naciones Unidas (, de tal manera que la adquisición de los resultados de aprendizaje de la asignatura proporciona capacitación y competencia para contribuir en cierta medida a su logro:

Objetivo 3: Salud y bienestar

Objetivo 4: Educación de calidad

1.2. Contexto y sentido de la asignatura en la titulación

Esta optativa, que pertenece al tercer módulo del máster en el que se incluyen las asignaturas del segundo semestre, permitirá a los alumnos profundizar en su formación como biotecnólogos moleculares, posibilitándoles configurar un currículo personalizado en el que podrán combinar conocimientos instrumentales, metodológicos, estadísticos, modelizadores y/o relativos a la creación y gestión de empresas biotecnológicas.

Esta asignatura optativa es realmente necesaria y coherente en este máster donde, después de que el alumno haya cursado las asignaturas obligatorias del primer cuatrimestre, pueda profundizar en el diseño, obtención y perfeccionamiento de nuevos compuestos para su evaluación biológica, con la finalidad última de establecer relaciones entre la estructura química y la actividad biológica que contribuyan al desarrollo de nuevos fármacos. Con esta asignatura se hará partícipe al alumno de los problemas que conlleva la interacción de los fármacos con el entorno biológico (habitualmente el cuerpo humano) en el que deben ejercer su efecto.

También es fundamental que los alumnos adquieran nociones del funcionamiento de la industria farmacéutica, uno de los sectores industriales más dinámicos que, estando relacionada con la salud, continúa creciendo debido a la demanda social de nuevos medicamentos más eficaces, seguros y personalizados.

Esta asignatura optativa contribuye a dar respuesta a todos estos aspectos que no se abordan en las otras asignaturas del máster.

1.3. Recomendaciones para cursar la asignatura

Es recomendable un seguimiento continuo de la asignatura.

2. Competencias y resultados de aprendizaje

2.1. Competencias

Al superar la asignatura, el estudiante será más competente para:

Competencias básicas:

CB6 - Poseer y comprender conocimientos que aporten una base u oportunidad de ser originales en el desarrollo y/o aplicación de ideas, a menudo en un contexto de investigación.

CB7 - Que los estudiantes sepan aplicar los conocimientos adquiridos y su capacidad de resolución de problemas en entornos nuevos o poco conocidos dentro de contextos más amplios (o multidisciplinares) relacionados con su área de estudio.

CB8 - Que los estudiantes sean capaces de integrar conocimientos y enfrentarse a la complejidad de formular juicios a partir de una información que, siendo incompleta o limitada, incluya reflexiones sobre las responsabilidades sociales y éticas vinculadas a la aplicación de sus conocimientos y juicios.

CB9 - Que los estudiantes sepan comunicar sus conclusiones y los conocimientos y razones últimas que las sustentan a públicos especializados y no especializados de un modo claro y sin ambigüedades.

CB10 - Que los estudiantes posean las habilidades de aprendizaje que les permitan continuar estudiando de un modo que habrá de ser en gran medida autodirigido o autónomo.

Competencias específicas:

CE05 - Diseñar ensayos celulares y animales de toxicidad, de biodisponibilidad y de efectividad de compuestos bioactivos.

CE06 - Aplicar técnicas estadísticas para llevar a cabo estudios que relacionen estructura molecular con actividad biológica y permitan generar modelos predictivos.

CE018 - Evaluar el interés de una molécula o estructura biológica determinada como diana terapéutica.

CE019 - Conocer las herramientas básicas de la Química Médica.

CE020 - Diseñar ensayos farmacocinéticos y farmacodinámicos adaptados a compuestos concretos.

CE021 - Aplicar principios de diseño a la mejora de las propiedades ADMET de compuestos candidatos.

CE022 - Entender el proceso de aprobación y comercialización de un fármaco.

Competencias genéricas:

CG01 - Ordenar, analizar críticamente, interpretar y sintetizar información procedente de distintos tipos de fuentes, evaluando su fiabilidad.

CG02 - Desarrollar aplicaciones tecnológicas de los procesos bioquímicos y transferir soluciones a la industria en el sector alimentario, químico, cosmético, farmacéutico y sanitario.

CG03 - Aprender eficientemente mediante el estudio autónomo y adquirir un grado significativo de independencia.

CG04 - Aplicar los conocimientos adquiridos y resolver problemas en entornos nuevos o que le resulten poco familiares dentro de contextos más amplios (o multidisciplinares) relacionados con el área de estudio.

CG05 - Formular, analizar, evaluar y comparar soluciones nuevas o alternativas para distintos problemas.

CG07 - Desarrollar capacidad para la crítica y la autocrítica.

CG09 - Desarrollar un proyecto, participando en las etapas de búsqueda bibliográfica, planificación de experimentos, obtención de resultados, interpretación, y difusión de los mismos.

2.2. Resultados de aprendizaje

El estudiante, para superar esta asignatura, deberá demostrar los siguientes resultados:

1. Conocer las principales clases de dianas terapéuticas para las que existen fármacos.

2. Conocer las principales herramientas de diseño utilizadas en Química Médica.

3. Conocer los ensayos de ADMET que se efectúan a una molécula candidata para evaluar su potencialidad como fármaco.

4. Conocer las estrategias de la Química Médica para mejorar las propiedades de ADMET de un compuesto.

5. Comprender el itinerario que sigue un compuesto evaluado preclínicamente hasta convertirse en un fármaco comercializado.

2.3. Importancia de los resultados de aprendizaje

Sirven, en primer lugar, para introducir a los estudiantes en el mundo de la química médica y su relación con los fármacos, así como todo el recorrido que estos siguen hasta llegar al mercado.

Permiten al estudiante afrontar la síntesis de un medicamento sencillo dado con las herramientas básicas de diseño en Química Médica (síntesis orgánica y herramientas computacionales).

Proporcionan a los alumnos herramientas de análisis computacional de las características de una molécula biológicamente activa con el fin de establecer relaciones estructura-actividad (SAR).

Todo lo expuesto anteriormente será de gran ayuda para afrontar con éxito el aprendizaje de otras asignaturas del máster y también durante el futuro desarrollo profesional.

3. Evaluación

3.1. Tipo de pruebas y su valor sobre la nota final y criterios de evaluación para cada prueba

El estudiante deberá demostrar que ha alcanzado los resultados de aprendizaje previstos mediante las siguientes actividades de evaluación.

Se llevará a cabo una evaluación continua, no obstante, también se tendrá la opción de realizar la prueba global según el calendario de exámenes de la UZ para las dos convocatorias oficiales.

Las actividades y criterios de evaluación de las que constan la evaluación continua y la prueba global (primera y segunda convocatoria) se describen a continuación.

Evaluación continua

1. Resolución de Problemas y Casos Prácticos (20% de la CF)

La resolución de estos ejercicios constituye un trabajo individual o en grupo de los estudiantes, según se acuerde. La resolución de estos problemas se llevará a cabo en el aula o se les solicitará a los estudiantes entregarlos al final de cada sesión o en el tiempo designado, siguiendo las pautas y el formato de presentación que se marcará. Las calificaciones y los propios ejercicios corregidos se pondrán a disposición de los estudiantes para su revisión.


2. Examen Teórico (50% de la CF)

La prueba escrita estará constituida por preguntas de tipo test o preguntas que requieran respuestas cortas (pruebas de respuesta limitada) o que exijan un desarrollo amplio del tema (pruebas de ensayo o respuesta libre y abierta).

Para la realización del examen, el alumno podrá consultar la bibliografía presencial que estime oportuna (sin que puedan consultarse páginas webs o similar).

3. Pruebas de evaluación de las sesiones prácticas de ordenador (30% de la CF)

El estudiante ha de demostrar el buen aprovechamiento de las sesiones de prácticas.

Se valorará: 1. El desarrollo de la práctica por parte del alumno: es decir, el modo en que el alumno lleva a cabo la práctica teniendo en cuenta los siguientes criterios: - El alumno es capaz de trabajar de forma autónoma siguiendo el protocolo. 2. El informe presentado al finalizar las prácticas, teniendo en cuenta los siguientes criterios: - Describe de forma conveniente los métodos utilizados - Interpreta de forma correcta los resultados.


4. Actividades complementarias (hasta 1 punto extra sobre la CF)

Las actividades (seminarios, conferencias, debates, etc.) que se puedan proponer con carácter voluntario podrán suponer una nota extra sobre la calificación final de la asignatura de hasta un máximo de 1 punto.

CF = 0.20 NResolución Problemas + 0.50 NExamen Teórico + 0.30 NSesiones Prácticas


Evaluación global (100% de la CF)

1. Examen Teórico (100% de la CF)

La prueba escrita estará constituida por preguntas de tipo test o preguntas que requieran respuestas cortas (pruebas de respuesta limitada) o que exijan un desarrollo amplio del tema (pruebas de ensayo o respuesta libre y abierta).

Para la realización del examen en la evaluación global, el alumno no podrá consultar la bibliografía.

CF = 1 NExamen Teórico


Así pues, la calificación global (CG) de la asignatura será la de la calificación final (CF), calculada como la media ponderada de las actividades de evaluación descritas  + la posible nota extra derivada de las actividades complementarias. La nota extra mencionada sólo se sumará a la CF si ésta es mayor o igual a 4 puntos sobre 10, tanto en primera, como en segunda convocatoria. La CG no podrá en ningún caso, superar la calificación numérica de 10.



*** La calificación global (CG) resultará de la adición a CF de la nota extra (hasta 1 punto), obtenida de las tareas complementarias realizadas con carácter voluntario. Estos sólo se sumarán si CF es igual o mayor a 4, en ambas convocatorias


En la evaluación de las pruebas descritas se valorará positivamente la exactitud, rigurosidad y planteamiento de las respuestas, así como la argumentación y análisis crítico de las mismas. Igualmente, se valorará la comprensión de los conceptos y procesos, y la capacidad de interrelacionarlos, así como la concreción, la claridad, el orden y la presentación.

Si se detecta y confirma plagio u otras acciones fraudulentas, será motivo suficiente para la calificación con la nota más baja posible de la prueba correspondiente.


La evaluación de esta asignatura está planificada para su realización de forma presencial, siempre y cuando sea posible. En caso contrario, y siguiendo las directrices marcadas en su caso, se adaptarán las actividades de evaluación para posibilitar su realización en remoto, intentando mantener, en la medida de lo posible, la tipología y criterios que se exponen aquí.

4. Metodología, actividades de aprendizaje, programa y recursos

4.1. Presentación metodológica general

El proceso de aprendizaje que se ha diseñado para esta asignatura se basa en clases expositivas de carácter participativo que se complementarán con clases de problemas, seminarios (podrán ser impartidos por profesionales), prácticas de ordenador y tutorías. Se expondrán los contenidos teóricos del temario de la asignatura, así como ejemplos prácticos que clarifiquen los conceptos expuestos.

4.2. Actividades de aprendizaje

El programa que se ofrece al estudiante para ayudarle a lograr los resultados previstos comprende las siguientes actividades:

Lección magistral

Clases magistrales expositivas participativas impartidas por el profesor. También podrán intervenir expertos externos y/o los propios alumnos.

Resolución de problemas y casos

El profesor propondrá problemas y casos prácticos para su resolución individual o en grupos. Las posibles soluciones a los problemas planteados se pondrán en común, promoviéndose la participación de los alumnos. Además de lo anterior, el profesor propondrá problemas y casos prácticos como tareas a realizar por el alumno.

Prácticas de laboratorio

Los alumnos realizarán prácticas de informática correspondientes al programa de prácticas. Estas actividades instruirán al alumno en cómo abordar las técnicas experimentales o los métodos computacionales, presentar datos y resultados proporcionados por la aplicación de estos. Finalmente, los resultados serán puestos en común y discutidos con los compañeros. Esta parte de la asignatura requiere de un trabajo individual por parte del alumno. Estas actividades permitirán al alumno adquirir la capacidad y destrezas necesarias para describir, cuantificar, analizar y evaluar críticamente los resultados obtenidos, así como para utilizar de forma autónoma las técnicas experimentales y métodos relacionados con este Master y diseñar alternativas técnicas y metodológicas.

Debates, seminario y conferencias

Tutela personalizada profesor-alumno

Trabajo autónomo del alumno

Pruebas de evaluación

4.3. Programa

Programa de teoría

MÓDULO I. Dianas de fármacos y fármacos

1- Enzimas y receptores como dianas farmacológicas

2- Ácidos nucleicos y otras dianas farmacológicas

3- Agentes antimicrobianos

4- Agentes anticancerígenos

5- Fármacos para el sistema nervioso central

6-Otros fármacos

MODULO II. Herramientas básicas en Química Médica

7- Encontrar compuestos cabecera

8- Síntesis combinatoria

9- Fármacos quirales y su síntesis

10- (Q)SARs para guiar la Química Médica

11- Ordenadores en Química Médica

MODULO III. Caracterización del fármaco: farmacocinética y farmacodinámica

12- Caracterización química de los compuestos cabecera

13- Farmacocinética y farmacodinámica

14- Seguridad y Toxicología

15- Modelos animales de enfermedad

MÓDULO IV. Estrategias químicas para mejorar los fármacos

16- Mejora de la solubilidad y de la afinidad por la diana

17- Mejora de la estabilidad química y de la metabólica

18- Mejora de la unión de proteínas y de la permeabilidad

19- Disminución de la toxicidad

20- Mejora de la administración (profármacos y encapsulación)

MÓDULO V. De la droga al paciente

21- Propiedad intelectual y patentes en el descubrimiento de fármacos

22- Fundamentos de los ensayos clínicos

23- Llevar la droga al mercado

24- Ejemplos ilustrativos en descubrimiento de fármacos


Nota: El orden de estos temas puede cambiar, en función de las necesidades docentes y de organización.


Programa de prácticas.  El alumno realizará una práctica de tipo A o una práctica de tipo B

Práctica tipo A.  Durante 7 sesiones informáticas de 3 horas, el alumno convertirá una molécula (hit), activa frente a una diana de estructura conocida, en un lead, abordando idealmente todo lo siguiente:

  • Diseño de una ruta sintética del hit que facilite la síntesis de derivados
  • Cálculo de su solubilidad y sus propiedades ADMET
  • A la vista de estas propiedades y de la actividad farmacológica deseada: propuesta de variantes mejoradas mediante diseño de derivados o mediante búsqueda de análogos por similitud, subestructura o farmacóforo
  • Propuesta de una formulación y un protocolo de administración para el ensayo de su actividad farmacológica en un modelo animal
  • Redacción de una solicitud de patente
  • Diseño de un ensayo clínico de Fase I


Práctica tipo B.  Durante 7 sesiones informáticas de 3 horas, el alumno se encargará de rediseñar un fármaco proteico para tratar de:

  • Mejorar la estabilidad proteica (solubilidad, estabilidad conformacional, tendencia a agregación, presencia de secuencias de proteólisis o de modificación)
  • Incorporar, si procede, funcionalidades de vehiculización celular
  • Planear estrategias de optimización de su afinidad por la diana.


El alumno diseñará una nueva secuencia del fármaco proteico que, con los menos cambios posibles, resuelva los problemas iniciales de la molécula. También diseñará un vector de expresión adecuado para producir el fármaco de forma recombinante. En el caso de tener que diseñar una vacuna, en lugar de un vector de expresión se diseñará un vector de inmunización.


Nota: El programa de prácticas podría verse ligeramente alterado, en función de las necesidades docentes y de organización.

4.4. Planificación de las actividades de aprendizaje y calendario de fechas clave

Calendario de sesiones presenciales y presentación de trabajos

Se trata de una asignatura de 6 ECTS que está programada dentro del grupo de las optativas que se pueden cursar en el segundo semestre del primer curso del Máster de Biofísica y Biotecnología Cuantitativa.

Toda la información sobre horarios y calendario de exámenes se publica en la web de la Facultad de Ciencias.

En reprografía y/o a través del Anillo Digital Docente se proporcionará al alumno diverso material docente.


La docencia de esta asignatura está planificada para su realización de forma presencial, siempre y cuando sea posible. En caso contrario, y siguiendo las directrices marcadas en su caso, se adaptarán las actividades de aprendizaje para posibilitar su realización en remoto, intentando mantener, en la medida de lo posible, la tipología que se expone aquí.

4.5. Bibliografía y recursos recomendados