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Academic Year: 2019/20

547 - Master's in Biomedical Engineering


Teaching Plan Information

Academic Year:
2019/20
Subject:
69328 - Optical technologies in biomedicine
Faculty / School:
110 - Escuela de Ingeniería y Arquitectura
Degree:
547 - Master's in Biomedical Engineering
ECTS:
3.0
Year:
1
Semester:
Second semester
Subject Type:
Optional
Module:
---

1. General information

2. Learning goals

3. Assessment (1st and 2nd call)

4. Methodology, learning tasks, syllabus and resources

4.1. Methodological overview

The methodology followed in this course is oriented towards achievement of the learning objectives. A wide range of teaching and learning tasks are implemented, such as lectures where the main contents are presented and discussed; laboratory sessions, assignments, and autonomous work.

Students are expected to participate actively in the class throughout the semester. 

4.2. Learning tasks

The course includes the following learning tasks:

  • A01 Lectures (22 hours). This activity will take place in the classroom. The teacher will present the main course contents such as several non intrusive optical measurement techniques, which provide information on the mechanical properties of biological materials, and some representative applications. The course materials (slides and texts) for each topic are given to the students in advance.
  • A03 Laboratory sessions (6 hours). The laboratory practice will take place in the laboratories of the Applied Physics Department at the Sciences Faculty, at dates and time agreed with the students. They are activities carried out in specific spaces with specialized equipment. There are 3 two-hour sessions. In the first session, Moiré techniques are used for measuring the shape of a knee prosthesis. In the second session, speckle pattern interferometry techniques are used for measuring the deformation of an elastic material. In the third session, particle image velocimetry is used to measure the flow in an in vitro aneurysm model. The lab tasks are done in pairs and students are given in advance the instructions to follow in each session. Each team is required to submit a written report for each session. The assessment of these reports is one of the assessment activities, which are detailed in the Assessment Section.
  • A05 Assignments. There will be one assignment, to be done individually. It will be a written report on a topic chosen by the student, with the approval of the teacher, and related to the course contents. The report will consist on a brief summary of a research or popular science paper, along with the student personal opinion on the subject covered in the paper. The assessment of this report is one of the assessment activities, which are detailed in the Assessment Section.
  • A06 Tutorials. Students may ask doubts or review and discuss the materials and topics presented in both theory and practice sessions.
    A08 Assessment. A set of written tests and submission of reports, which will be used for evaluating the student progress, as detailed in the corresponding Assessment Section.

4.3. Syllabus

The course will address the following topics:

1. Fundamentals of Optics.

Reflection, refraction and imaging. Superposition of light waves: polarization and interferences. Coherence. Diffraction. Diffusion. Lasers: types and properties.

2. Moiré techniques for topography studies.

The moiré effect. Analysis of moiré patterns. Shape measurements. Applications.

3. Laser speckle techniques for studying the mechanical properties of materials (tissue, prosthesis, ...)

Speckle and its properties. Methods for speckle comparison. Defect detection. Strain measurement. Applications.

4. Velocimetry techniques for studying biological flows.

Particle image velocimetry. Digital holography. Applications.

5. Microscopy techniques.

Compound microscope. Confocal microscope. Holographic microscopy. Applications.

6. Optical Tomography.

Diffuse optical tomography (DOT). Optical coherence tomography (OCT). Optical diffraction tomography (ODT). Applications.

7. Therapeutic uses of lasers.

Light-matter interaction. Optical tweezers. Laser scalpel. Laser ablation. Applications.

4.4. Course planning and calendar

Further information concerning the timetable, classroom, office hours, assessment dates and other details regarding this course, will be provided on the first day of class or please refer to the EINA website.

 

4.5. Bibliography and recommended resources

http://biblos.unizar.es/br/br_citas.php?codigo=69328&year=2019


Curso Académico: 2019/20

547 - Máster Universitario en Ingeniería Biomédica


Información del Plan Docente

Año académico:
2019/20
Asignatura:
69328 - Tecnologías ópticas en Biomedicina
Centro académico:
110 - Escuela de Ingeniería y Arquitectura
Titulación:
547 - Máster Universitario en Ingeniería Biomédica
Créditos:
3.0
Curso:
1
Periodo de impartición:
Segundo semestre
Clase de asignatura:
Optativa
Materia:
---

1. Información Básica

1.1. Objetivos de la asignatura

La asignatura y sus resultados previstos responden a los siguientes planteamientos y objetivos:

El objetivo de la asignatura es que el estudiante comprenda y sepa utilizar un conjunto de técnicas ópticas para obtener información útil en algunas aplicaciones biomédicas.

La asignatura se centra en un conjunto de técnicas que utilizan la interacción entre la luz y los materiales para modificar u obtener información sobre esos materiales. La revisión de estas técnicas en el contexto de la biomedicina pretende familiarizar al alumno con sus aplicaciones al estudio de células, tejidos, vasos sanguíneos, prótesis,...

La asignatura debe llevar al estudiante a conocer un abanico de técnicas ópticas de medida de diversas magnitudes físicas y a ser capaz de utilizarlas para obtener información relevante en algunas aplicaciones biomédicas, teniendo en cuenta las particularidades de cada aplicación, así como las posibilidades y limitaciones de dichas técnicas.

1.2. Contexto y sentido de la asignatura en la titulación

La asignatura Tecnologías Ópticas en Biomedicina es una asignatura optativa enmarcada dentro de las Tecnologías Horizontales, que pueden servir a las dos especialidades del máster.

Uno de los objetivos del máster de Ingeniería Biomédica es adaptar las herramientas y técnicas disponibles en el campo de la ingeniería al ámbito biomédico. Hoy en día las técnicas ópticas no intrusivas se utilizan en infinidad de aplicaciones prácticas en campos diferentes entre los que se incluye el ámbito biomédico. Por ello un conocimiento profundo de dichas técnicas proporcionará al alumno las herramientas necesarias para resolver problemas de medida que puedan surgir en dicho ámbito.

Por otro lado, esta asignatura permitirá al alumno desarrollar su capacidad crítica y de análisis de forma que sea capaz de tomar decisiones debidamente razonadas. Dado que los estudios de máster constituyen un puente hacia el mundo laboral su formación se verá complementada en aspectos que trascienden el ámbito académico.

1.3. Recomendaciones para cursar la asignatura

Los profesores encargados de impartir la docencia pertenecen al área de Física Aplicada

No es requisito imprescindible haber cursado asignaturas previas ni en los distintos grados que dan acceso al máster ni en los cuatrimestres anteriores del plan de estudios de este máster.

2. Competencias y resultados de aprendizaje

2.1. Competencias

Al superar la asignatura, el estudiante será más competente para...

Poseer y comprender conocimientos que aporten una base u oportunidad de ser originales en el desarrollo y/o aplicación de ideas, a menudo en un contexto de investigación (CB. 6)

Que los estudiantes sepas aplicar los conocimientos adquiridos y su capacidad de resolución de problemas en entornos nuevos o poco conocidos dentro de contextos más amplios (o multidisciplinares) relacionados con su área de estudio (CB.7)

Que los estudiantes sean capaces de integrar conocimiento y enfrentarse a la complejidad de formular juicios a partir de una información que, siendo incompleta o limitada, incluya reflexiones sobre las responsabilidades sociales y éticas vinculadas a la aplicación de sus conocimientos y juicios (CB.8)

Que los estudiantes sepan comunicar sus conclusiones y los conocimientos y razones últimas que las sustentan a públicos especializados y no especializados de un modo claro y sin ambigüedades (CB.9)

Que los estudiantes posean las habilidades de aprendizaje que les permitan continuar estudiando de un modo que habrá de ser en gran medida autodirigido o autónomo (CB.10)

Poseer las aptitudes, destrezas y método necesarios para la realización de un trabajo de investigación y/o desarrollo de tipo multidisciplinar en cualquier área de la Ingeniería Biomédica (CG.1)

Ser capaz de usar las técnicas, habilidades y herramientas de la Ingeniería necesarias para la resolución de problemas del ámbito biomédico y biológico (CG.2)

Ser capaz de comprender y evaluar críticamente publicaciones científicas en el ámbito de la Ingeniería Biomédica (CG.3)

Ser capaz de aprender de forma continuada y desarrollar estrategias de aprendizaje autónomo (CG.4)

Ser capaz de gestionar y utilizar bibliografía, documentación, legislación, bases de datos, software y hardware específicos de la ingeniería biomédica (CG.5)

Ser capaz de analizar, diseñar y evaluar soluciones a problemas del ámbito biomédico mediante conocimientos y tecnologías avanzados de biomecánica, biomateriales e ingeniería de tejidos (CO.3)

2.2. Resultados de aprendizaje

El estudiante, para superar esta asignatura, deberá demostrar los siguientes resultados...

Ser capaz de elegir la técnica óptica más adecuada en algunas aplicaciones biomédicas, sabiendo la magnitud física a medir, el rango de valores esperados y la resolución espacial y temporal deseadas.

Ser capaz de explicar el funcionamiento y las aplicaciones biomédicas típicas de las técnicas ópticas estudiadas.

Ser capaz de aplicar algunas de las técnicas a casos prácticos.

2.3. Importancia de los resultados de aprendizaje

Esta asignatura permitirá al estudiante comprender la información que las técnicas ópticas pueden proporcionar en lo referente a la medida no invasiva de las propiedades mecánicas de materiales biológicos (células, tejidos, vasos sanguíneos, prótesis,..). Dado que alguna de estas técnicas se encuentran ya en aplicaciones comerciales mientras que otras se encuentran todavía en fase de desarrollo, la formación adquirida en esta asignatura puede ayudar al alumno a potenciar su carrera profesional, bien en el campo de la investigación o en un campo más comercial.

3. Evaluación

3.1. Tipo de pruebas y su valor sobre la nota final y criterios de evaluación para cada prueba

El estudiante deberá demostrar que ha alcanzado los resultados de aprendizaje previstos mediante las siguientes actividades de evaluacion

  • Examen final (50%)

Examen escrito, con puntuación de 0 a 10 puntos, común para todos los grupos de la asignatura. La prueba consta de una serie de cuestiones teórico-prácticas, con una duración estimada de 2 h.

El alumno ha de obtener una puntuación mínima total de 4 puntos sobre 10 en el examen final.  Se dispondrá de una prueba global en cada una de las convocatorias establecidas a lo largo del curso, en las fechas y horarios determinados por la Escuela.

  • Prácticas de laboratorio (30%)

Puntuación de 0 a 10 puntos. El alumno elaborará un informe de cada una de las prácticas realizadas, que serán calificados de 0 a 10 puntos. La nota final se computará como la media de las calificaciones obtenidas en los informes.

  • Trabajo de Asignatura (20%)

Puntuación de 0 a 10 puntos. En la evaluación se tendrá en cuenta la capacidad de síntesis y asimilación mostrada en la memoria presentada,

4. Metodología, actividades de aprendizaje, programa y recursos

4.1. Presentación metodológica general

El proceso de aprendizaje se desarrollará en varios niveles: clases magistrales en las que se fomentará la participación del alumno, clases prácticas de laboratorio y realización de trabajos relacionados con los temas presentados en clase. La metodología que se propone trata de fomentar el trabajo continuado del estudiante.

4.2. Actividades de aprendizaje

El proceso de aprendizaje que se ha diseñado para esta asignatura se basa en las siguientes actividades formativas:

A01 Clase magistral participativa (22 horas). Esta actividad se realizará en el aula de forma presencial. El profesor expondrá los contenidos fundamentales de la asignatura. Se presentan diferentes técnicas ópticas de medida no invasiva que permiten obtener información sobre las propiedades mecánicas de materiales biológicos, incluyendo algunas aplicaciones representativas. Se les proporciona a los alumnos las diapositivas de cada una de las lecciones con suficiente antelación y los textos donde se describen los contenidos incluidos en esas diapositivas.

 

A03 Prácticas de laboratorio (6 horas). Las prácticas de laboratorio se desarrollarán en los laboratorios del Departamento de Física Aplicada en la Facultad de Ciencias, en fecha y hora a concretar de acuerdo con los alumnos matriculados.

Son actividades desarrolladas en espacios especiales con equipamiento especializado. La parte presencial supone 6 horas en un laboratorio, distribuidas en tres sesiones de dos horas. En la primera sesión se utilizan técnicas de Moiré para la medida de la forma de  una prótesis de rodilla. En la segunda sesión se utilizan técnicas de interferometría de moteado para la medida de deformaciones de un material elástico. En la tercera sesión se utiliza la velocimetría de imágenes de partículas para la medida in vitro del flujo en un aneurisma. Las prácticas se hacen por equipos de dos personas, a los que se les da por adelantado el guión de cada práctica. Se requiere que entreguen un informe escrito por práctica y por equipo. Suponen una de las partes de la evaluación, que se detalla en la sección correspondiente a las actividades de evaluación. 

A05 Realización de trabajos. El trabajo se realizará de forma individual. Consistirá en un informe escrito sobre un tema elegido por el alumno, con el visto bueno del profesor, y relacionado con los temas presentados en clase. El informe consistirá en un breve resumen de un artículo de investigación o divulgativo sobre el tema elegido, junto con la opinión personal sobre el mismo. Supone una de las partes de la evaluación, que se detalla en la sección correspondiente a las actividades de evaluación. 

A06 Tutoría. Horario de atención personalizada al alumno con el objetivo de revisar y discutir los materiales y temas presentados en las clases tanto teóricas como prácticas. 

A08 Evaluación (2 horas). Conjunto de pruebas escritas teórico-prácticas y presentación de informes o trabajos utilizados en la evaluación del progreso del estudiante. El detalle se encuentra en la sección correspondiente a las actividades de evaluación.

4.3. Programa

El programa que se ofrece al estudiante para ayudarle a lograr los resultados previstos comprende las siguientes lecciones:

1. Fundamentos de Óptica.

Reflexión, refracción y formación de imágenes. Superposición de ondas de luz: polarización e interferencias. Coherencia. Difracción. Difusión. Láseres: tipos y propiedades.

2. Técnicas de moiré para estudios de topografía.

Efecto moiré. Análisis de las figuras de moiré. Medida de formas. Ejemplos de aplicación.

3. Técnicas de moteado laser para el estudio de propiedades mecánicas de materiales (tejidos, prótesis,...)

Moteado y sus propiedades. Métodos de comparación de moteados. Detección de defectos. Medida de deformaciones. Ejemplos de aplicación.

4. Técnicas de velocimetría para el estudio de flujos biológicos.

Velocimetría de imágenes de partículas. Holografía digital. Ejemplos de aplicación

5. Técnicas de microscopía.

Microscopio compuesto. Microscopio confocal. Microscopía holográfica. Aplicaciones.

6. Tomografía óptica.

Tomografía óptica difusa (DOT). Tomografía coherente óptica (OCT). Tomografía difractiva óptica (ODT). Aplicaciones.

7. Aplicaciones terapéuticas del láser.

Interacción luz-materia. Pinzas ópticas. Bisturí láser. Ablación láser. Aplicaciones.

 

4.4. Planificación de las actividades de aprendizaje y calendario de fechas clave

El calendario de la asignatura de las sesiones presenciales en el aula como de las sesiones de laboratorio, estará determinado por el calendario académico que el centro establezca para el curso correspondiente. Las fechas para las sesiones de laboratorio se fijarán de acuerdo con los alumnos matriculados. El calendario de presentación de trabajos se anunciará convenientemente al inicio de la asignatura.

La asignatura se imparte en el cuatrimestre de primavera. Entre las principales actividades previstas se encuentran la exposición de los contenidos teóricos, la realización de prácticas de laboratorio y la realización de trabajos relacionados con los contenidos de la asignatura.

Las prácticas de laboratorio se fijarán de acuerdo con los alumnos matriculados.

Las fechas de inicio y fin de las clases teóricas y las pruebas de evaluación global serán las fijadas por la Escuela de Ingeniería y Arquitectura y publicadas en la página web del máster (http://www.masterib.es). Las fechas de entrega de los trabajos se darán a conocer con suficiente antelación en clase.

4.5. Bibliografía y recursos recomendados

http://biblos.unizar.es/br/br_citas.php?codigo=69328&year=2019